برای تائید صحت، دقت و قابل اعتماد بودن نمونه رنگ آمیزی شده وجود کنترل مثبت و کنترل منفی بسیار حائز اهمیت است. علاوه بر این، نگهداری دقیق این سوابق (کنترل مثبت – کنترل منفی) برای اطمینان از عملکرد ما و رسیدن به جواب صحیح در آزمایش ایمونوهیستوشیمی در آزمایشگاهها بسیار مهم است. چرا که تغئیر در شرایط آزمایش و وضعیت بافت ممکن است در تکرار پذیری رنگ آمیزی تاثیر بگذارد. نتیجه مثبت از کنترل مثبت حتی اگر نمونه ها منفی باشند نشانگر درست و معتبر بودن این روش خواهد بود و تایید کننده اعتبار نتایج منفی می باشد.
به طور کلی کنترل مثبت نمونه ی حاوی مولکول هدف در مکان شناخته شده ی آن می باشد و خصوصیات بافت شناسی و سلول شناسی آن را می توان با استفاده از یک رنگ فلوروکروم و یا مولکول های کوروموژنیک مشخص نمود. به طور مثال، در بررسی آنتی بادی ضد مولکولی انسولین ، نمونه ی کنترل مثبت باید شامل بخش هایی از لوزالمعده و جزایر لانگرهانس باشد. این آنتی بادی علیه سلول های بتای تولید کننده ی انسولین مجود در جزایر لانگرهانس بوده و نباید با مولکول های مشابه انسولین واکنش دهد.
در جدول زیر لیست تمامی کنترل های مثبت آنتی بادی های ایمونوهیستوشیمی شرکت سماء تشخیص بیان شده است.